Bioinformática inteligente en la nube

Nuestra tecnología

Sube tus secuencias genómicas. Nuestros servidores se encargan del análisis completo sin configuraciones, sin servidores locales, sin complicaciones.

gen4epi es una plataforma bioinformática en la nube que automatiza todo el flujo de análisis genómico, desde la subida y procesamiento de secuencias genómicas hasta la obtención de resultados bioinformáticos completos en nuestros servidores. Una vez generados, un asistente basado en inteligencia artificial ofrece apoyo en la interpretación de los resultados, facilitando la comprensión de patrones, relaciones genéticas y contextos epidemiológicos sin necesidad de conocimientos informáticos avanzados.

Las secuencias se almacenan y comprimen mediante un algoritmo optimizado que conserva toda la información genética reduciendo al mínimo el espacio necesario. Nuestros servidores gestionan el procesamiento de forma remota, sin usar recursos locales del usuario y garantizando rapidez, escalabilidad y seguridad.

Los resultados incluyen tablas dinámicas, visualizaciones interactivas y informes automáticos que facilitan la comprensión de grandes volúmenes de datos. Además, el sistema integra herramientas GIS y análisis filogenéticos para explorar patrones epidemiológicos que reflejan la evolución genética de las cepas.

Con su inteligencia artificial integrada, gen4epi detecta patrones relevantes, genera alertas tempranas ante comportamientos inusuales y contribuye a una vigilancia epidemiológica más rápida, precisa y proactiva.

Características

Procesamiento y optimización en la nube

Procesamiento y optimización en la nube

Nuestros servidores ejecutan los análisis bioinformáticos de forma remota, sin usar tus recursos locales. Las secuencias se almacenan y comprimen mediante algoritmos que reducen el espacio sin pérdida de información

Algoritmo de compresión

Ciberseguridad y confidencialidad

Todos los datos genómicos y resultados se procesan bajo protocolos de seguridad avanzada, con cifrado en tránsito y en reposo, garantizando la confidencialidad y trazabilidad de la información

Multiespecie y adaptable

Multiespecie y personalizable

Compatible con una gran variedad de patógenos zoonóticos. La plataforma es adaptable según las necesidades del usuario

Integración GIS

Integración GIS

Visualiza los resultados en mapas dinámicos y detecta relaciones espaciales entre cepas y brotes para mejorar el análisis epidemiológico

Árboles filogenéticos

Análisis filogenéticos

Analiza las relaciones genéticas entre cepas mediante árboles filogenéticos interactivos

IA local

IA local

Detecta patrones, genera alertas y apoya la interpretación científica con inteligencia artificial integrada

Análisis disponibles

A partir de tus secuencias, gen4epi ejecuta de forma automática un conjunto completo de análisis de vigilancia genómica por muestra: control de calidad, serotipado, tipificación, detección de resistencia a antibióticos, identificación de genes de virulencia y caracterización de plásmidos.

Control de calidad

Evaluación de la calidad de las lecturas y del ensamblado: filtrado, cobertura, integridad de los contigs y detección de posibles contaminaciones.

Serotipado

Predicción automática del serotipo, adaptada al patógeno analizado.

Tipificación MLST

Asignación del tipo de secuencia para la caracterización rápida y comparable de cepas.

Resistencia a antibióticos

Detección de genes y mutaciones de resistencia a antibióticos (resistencia antimicrobiana) presentes en el genoma, para anticipar el perfil de resistencia de cada cepa.

Genes de virulencia

Identificación de los genes y factores de virulencia que determinan el potencial patogénico de cada cepa.

Plásmidos

Caracterización de replicones, reconstrucción de plásmidos y detección de las resistencias que portan.

cgMLST y brotes

Tipificación a nivel de genoma core y comparación entre aislados para la investigación de brotes.

Anotación genómica

Anotación estructural y funcional del genoma para situar genes y elementos de interés en su contexto.

Proyectos

Organismos e instituciones que emplean gen4epi en sus flujos de vigilancia genómica y epidemiológica.

Sistema Epidemiológico Integrado de Castilla y León

genDB Centro VISAVET

Sobre nosotros

gen4epi ha sido concebido y desarrollado dentro del Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria (VISAVET) de la Universidad Complutense de Madrid (UCM), integrando la experiencia científica del centro en vigilancia genómica, bioinformática y análisis epidemiológico.

VISAVET logo UCM logo

Julio Álvarez Sánchez – Equipo gen4epi

Julio Álvarez Sánchez

Investigador en epidemiología molecular y sanidad animal. Experiencia en vigilancia genómica aplicada a zoonosis.

Laura Torre Fuentes – Equipo gen4epi

Laura Torre Fuentes

Bioinformática especializada en genómica. Desarrollo de flujos de trabajo y visualización de resultados bioinformáticos.

Javier Hernández Carrillo – Equipo gen4epi

Javier Hernández Carrillo

Desarrollador de software científico. Responsable de la infraestructura de servidores y del desarrollo web de la plataforma.

Carlos Serna Bernaldo – Equipo gen4epi

Carlos Serna Bernaldo

Veterinario especializado en bioinformática y genómica bacteriana. Desarrollo de flujos de trabajos, visualización e interpretación de resultados.